7月29日,國(guó)際學(xué)術(shù)期刊RNA在線發(fā)表了中國(guó)科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院生物化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)研究所王恩多課題組的最新研究成果,解析了人胞質(zhì)亮氨酰-tRNA合成酶的CP發(fā)卡結(jié)構(gòu)域在酶催化過程中的功能和機(jī)制。
亮氨酰-tRNA合成酶(LeuRS)催化亮氨酸和對(duì)應(yīng)tRNALeu之間的酯化反應(yīng)。亮氨酸和異亮氨酸、甲硫氨酸、正纈氨酸的結(jié)構(gòu)非常相似,亮氨酰-tRNA合成酶對(duì)上述氨基酸的辨別能力很低,有可能生成錯(cuò)誤的氨基酰-tRNALeu。在進(jìn)化中,亮氨酰-tRNA合成酶在原始的催化結(jié)構(gòu)域之上招募了新的編校結(jié)構(gòu)域,對(duì)誤氨基;a(chǎn)物進(jìn)行水解,確保蛋白質(zhì)翻譯過程正確進(jìn)行。連接催化結(jié)構(gòu)域和編校結(jié)構(gòu)域之間的氨基酸序列被稱為CP發(fā)卡結(jié)構(gòu)域。人們普遍認(rèn)為,這一結(jié)構(gòu)域可能維持酶的空間結(jié)構(gòu),并參與了酶催化過程中的構(gòu)象變化,但對(duì)其細(xì)節(jié)卻知之甚少。
來自王恩多課題組的科研人員黃騫等刪除了人胞質(zhì)亮氨酰-tRNA合成酶的CP發(fā)卡結(jié)構(gòu)域,發(fā)現(xiàn)酶的氨基酸活化能力和氨基;芰ν耆珕适,tRNA結(jié)合能力極大削弱,而編校功能幾乎不受影響。他們構(gòu)建了一系列原核、真核和古細(xì)菌的嵌合體亮氨酰-tRNA合成酶,發(fā)現(xiàn)只有來自于真核生物酵母的亮氨酰-tRNA合成酶CP發(fā)卡結(jié)構(gòu)域可以替代人胞質(zhì)亮氨酰-tRNA合成酶CP發(fā)卡結(jié)構(gòu)域的功能。通過結(jié)構(gòu)和序列分析發(fā)現(xiàn),這一結(jié)構(gòu)域的柔性氨基酸殘基參與了酶催化過程中的構(gòu)象變化,對(duì)于酶的氨基酸活化能力和氨基;芰Φ陌l(fā)揮至關(guān)重要,而極性氨基酸殘基則負(fù)責(zé)酶與tRNALeu的結(jié)合過程。
這一結(jié)果有助于人們更好地了解亮氨酰-tRNA合成酶的催化原理,發(fā)現(xiàn)人胞質(zhì)亮氨酰-tRNA合成酶和致病菌亮氨酰-tRNA合成酶的結(jié)構(gòu)差異,有針對(duì)性地設(shè)計(jì)新的抗生素藥物。
該項(xiàng)工作得到了國(guó)家科技部、國(guó)家自然科學(xué)基金委和中國(guó)博士后科學(xué)基金會(huì)的支持。

CP發(fā)卡結(jié)構(gòu)域在亮氨酰-tRNA合成酶的一級(jí)序列和三級(jí)結(jié)構(gòu)中的位置(紫色)
