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黑河上游固氮細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)與多樣性研究獲得進(jìn)展

 氮是高寒生態(tài)系統(tǒng)的限制性營養(yǎng)元素,對固氮細(xì)菌多樣性及其影響因素的研究有助于解決高寒生態(tài)系統(tǒng)土壤氮缺乏的難題。 

  中國科學(xué)院寒區(qū)旱區(qū)環(huán)境與工程研究所科研人員在祁連山區(qū)冰溝選擇了兩種典型植被進(jìn)行樣方調(diào)查和土壤樣品采集。通過對其土壤理化性質(zhì)進(jìn)行測定,對兩種植被土壤中的固氮細(xì)菌多樣性和豐度用克隆文庫(clone library)和定量PCR技術(shù)進(jìn)行了檢測。 

  固氮基因(nifH)克隆文庫分析結(jié)果顯示,所有可鑒定的固氮細(xì)菌均屬于變形菌門,其中固氮螺菌(Azospirillum)是灌叢土壤中特有的固氮細(xì)菌;而莢瘤菌(Thiocapsa),德克斯氏菌(Derxia),外硫紅螺菌(Ectothiorhodospira),中慢生根瘤菌(Mesorhizobium),克雷白氏桿菌(Klebsiella),劍菌(Ensifer),甲基細(xì)胞菌(Methylocella)和假單胞菌(Pseudomonas)是草甸土壤中特有的固氮細(xì)菌。系統(tǒng)發(fā)育分析將nifH 基因的序列分為5個(gè)分支:分支I,II和III主要是來源于草甸土壤的nifH 序列,而分支IV主要由來源于灌叢土壤的nifH 序列組成。nifH 基因的香農(nóng)多樣性指數(shù)的變化范圍是1.5~2.8,草甸土壤中的多樣性高于灌叢土壤;nifH基因拷貝數(shù)的變化范圍是4.0×106~6.9×107 copies g-1 soil,草甸土壤中的拷貝數(shù)低于灌叢土壤。冗余分析表明:灌叢土壤中,nifH 基因的多樣性和拷貝數(shù)與地上生物量相關(guān);草甸土壤中,nifH 基因的多樣性主要受海拔的影響,而其拷貝數(shù)主要受土壤速效鉀的影響。
  該研究成果發(fā)表于Biogeosciences。

 

基因的拷貝數(shù)和多樣性指數(shù)(*顯著性水平為P < 0.05) 

 

    固氮細(xì)菌群落特征與環(huán)境因子間的RDA分析。RDA圖(Biplots方法)基于物種與環(huán)境變量間的線性相關(guān)模型在CanoDraw中生成。紅色箭頭和字體代表環(huán)境因子,藍(lán)色箭頭和黑色字體代表固氮細(xì)菌群落特征。